日本醫科大學附屬病院位于東京文京區，是日本醫科大學的大學附屬病院，也是日本厚生勞動省批準的特定機能病院。

日本醫科大學附屬病院至今已有100多年的歷史，1910年作為日本醫學校附屬病院成立以來，經歷過日本醫學專門學校附屬病院，舊制日本醫科大學附屬病院后發展成今天的擁有1000多張床位的大學綜合醫院。日本醫科大學附屬病院擁有日本靠前的內科，在癌癥的研究方面也有眾多成果。

2008年，日本醫科大學附屬病院被厚生勞動省指定為癌癥治療據點醫院，針對癌癥的化學治療法、放射線治療法、姑息治療實施和支援等，作為地區的中心醫院開設關于癌癥活動。日本醫科大學附屬病院各診療部門擁有眾多醫學界的權威及新興學者，并致力于以先端醫療設備和技術，提供更高端的醫療服務。

心臟血管內科

不僅進行先端的高度先進醫療,而且對多樣化及復雜化的一般的內科疾病患者做出正確的判斷，并進行著與個人特點相符合的治療。

在心血管內科對缺血性心疾病、心律失常、心力衰竭,大動脈疾病、末梢動脈疾病、糖尿病等有相應的專家進行治療,能對應所有心臟病治療。

神經內科

腦梗塞，腦出血等腦血管障礙、帕金森病，脊髓小腦變性癥，多發性硬化癥等脫髓疾病、髓膜炎等神經系感染癥、多發筋炎。重癥筋無力癥等的筋疾病、阿爾茨海默病等有認知障礙的疾病、頭痛或發麻等神經疾病的整體診療。

特別注重腦梗塞的早期診斷治療，每年接受300病例以上的腦梗塞患者住院治療。另外,對腦中風治療有腦中風專門隊伍 (Stroke Care Unit: SCU)、腦中風專職醫生進行治療,并對3小時以內的早期腦梗塞病例使用溶解血栓療法 (t-PA)。

腎臟內科

急性?慢性腎衰、高血壓、糖尿病性腎癥、慢性系球體腎炎，腎病、膠質原的腎臟障礙、遺傳性腎臟疾病、水電解質異常等內科腎臟疾患的整體進行診療。

特別是, 提倡慢性腎臟病(CKD)新概念,注重CKD對策。另外,積極采用先天性代謝疾病ファブリー病”的酶補充療法。另外,腎疾病以外的各種各樣的疾病，積極采用血漿交換在內的各種血液凈化療法。

血液內科

急性白血病、惡性淋巴腫等的造血器惡性腫瘤的化學療法有相當多的治療病例,取得良好的治療效果。另外,判斷病人治療適應能力以后，積極采用末梢血干細胞移植，骨髓移植等造血干細胞移植。對重癥較多的免疫力的抑制療法,取得了良好的成績,除此之外,還有各種貧血癥的治療,血小板總數減少癥等出血性疾病的治療。

腦神經外科

日本醫科大學腦神經外科于1964年日本把最初普及外科的近藤次繁醫生的兒子近藤駿四郎教授作為第一代傳統的腦神經外科。第2代中澤教授，第3代寺本教授的基本實現發展達到現在。

腦瘤，脊椎，以血管障礙為中心進行治療，特下垂體部的腫瘤在日本進行多的治療的是大學醫療機構。其他腦血管障礙，顱底腫瘤，脊髓腫瘤，臉痙攣和三叉神經痛等診療積極進行。

心臟血管外科

日本醫科大學附屬病院心臟血管外科手術是莊司佑名譽教授自1972年開始進行的已經近40年的歷史。至今已經進行有8000例子以上心臟大血管手術。

該專業的特征是通過循環器內科手術委托的冠狀動脈旁道策略在心率動下的off-pump CABG進行的，瓣膜癥合并的心房細微動的外科治療也是全國能力水平，起搏器和植型除細微動容器的樹叢和心力衰竭治療的心臟再同期兩室ペーシング等設備的植入病例在我國也屈指可數的病例數，也有對小兒川崎病冠狀動脈瘤乳幼兒期的孩子外科治療等。